1- Introduction: Ce chapitre se base sur des terminologie majeur de ce cours(energie, anabolisme et catabolisme) anisi que les differentes caracteristiques metaboliques. 2- Métabolisme énergétique des microorganismes Cette unité traite les source d’energie necessaire aux microorganismes ainsi que l’accepteur final d’electron decide le type trophique et respiratoire de chaque espece bacterienne. 3- Catabolismes des glucides Il s’agit de presenter differentes cycles metabolique et leur voie alternatives. 4- Etude et intérêt de quelques types métaboliques Il s’agit de presenter differentes type trophique des differentes bacteries ainsi que Organismes fermentants. 5- Catabolisme des autres composés organiques : Dans cette partie il s’agit de traité les catabolismes des proteines, lipides et les glucides. 6- Anabolisme et production de biomasse Il s’agit de presenter differentes biomasse produite.
 Travaux Pratiques :
TP1 : Fermentation alcoolique cher les levures (cas Saccharomyces cereviceae) en bioréacteur. TP2 : Fermentation lactique de quelques souches lactiques (essais sur bioréacteur). Pré-requis L’étudiant doit avoir : une bonne base en biochimie générale et microbiologie générale. connaitre les principales voies du métabolisme énergétique  Savoir la difference entre les différentes cycle métaboliques.  Visées d’apprentissage Cette matière doit permettre à l’étudiant de : savoir les differentes types trophique différencier les types respiratoire des microorganismes. Préciser le bilan énérgitique de chaque cycle métabolique. analyser le métabolisme énergétique des microorganismes et notamment chez les procaryotes du catabolisme des glucides et des autres composés organiques permettant notamment de connaître les mécanismes biochimiques impliqués et utilisés par les bactéries. Appliquer le cour au niveau de laboratoire concernant la fermentation lactique et alcooliques.